Líneas de investigación

Estudiamos los genomas de bacterias extremófilas acidófilas, como los miembros del género Acidithiobacillus, para entender su fisiología, su ecología y los mecanismos que les permiten prosperar en ambientes extremos. Mediante genómica comparativa y reconstrucción metabólica exploramos rutas de asimilación de carbono, nitrógeno, fósforo y azufre, la homeostasis del hierro y la regulación mediada por factores de transcripción, con aplicaciones en biominería.

Aplicamos estrategias genómicas y transcriptómicas para comprender la diversidad, la supervivencia y la patogenicidad de patógenos relevantes para la acuicultura, como Piscirickettsia salmonis, y la respuesta del salmón del Atlántico frente a infecciones y coinfecciones. Buscamos biomarcadores y genes candidatos que apoyen el diagnóstico y el manejo sanitario en la industria acuícola.

Desarrollamos proyectos de genómica eucarionte y microbiana en áreas de relevancia biotecnológica como la agricultura, la industria del vino y los alimentos del futuro. Esto incluye la búsqueda de genes candidatos en levaduras que afectan la calidad del vino, el estudio de especies vegetales nativas y de microorganismos del suelo y la filosfera, y el análisis transcriptómico de células musculares para la producción de carne cultivada.

Creamos soluciones bioinformáticas y tecnologías innovadoras para procesar y analizar grandes proyectos de secuenciación de ADN y otros datos ómicos, con énfasis en el estudio de la variación genética a distintos niveles de complejidad. Integramos genómica funcional, comparativa y evolutiva, genética estadística aplicada, biología de sistemas e inteligencia artificial para convertir datos en conocimiento biológico.